宮崎内科@大分です。 あまり自信はありませんが、似たビデオボードを使っていますので 気付いた点を書きます。
それならばと、dpkg-reconfigure xserver-xfree86 で RIVA TNT2 を設定すると、 startx で日医標準レセプトソフトが起動して、トラブルなく動きました。 OK ということでshutdown して、また起動するとXが起動せず、動かすためには、 dpkg-reconfigure xserver-xfree86 でまた同様の設定をし直さなくてはなりませ ん。
dpkg-reconfigure xserver-xfree86での再設定で 1)xserver driver は何を選択されましたか? nv ではいかがでしょうか? 2)途中でframebufferを使うか聞かれると 思いますが、no を選択されていますか? Use kernel framebuffer device interface? <No>